Là một ngành khoa học - kỹ thuật cơ mật đặc biệt thuộc lĩnh vực an ninh quốc gia, có chế độ công tác nghiêm ngặt, được trang bị phương tiện nhiệm vụ mật mã đặc thù chịu sự chỉ đạo thống nhất về chuyên môn nghiệp vụ từ Ban Cơ yếu Chính phủ. Ban Cơ yếu Chính phủ đã sớm ban hành các văn bản pháp lý quy định về việc quản lý nghiên cứu khoa học kỹ thuật mật mã.

Chiều 03/10/2017, tại Hà Nội, Văn phòng Trung ương Đảng đã ký kết với Ban Cơ yếu Chính phủ bản Kế hoạch bảo đảm bảo mật, xác thực và giám sát an toàn thông tin cho các hệ thống công nghệ thông tin cơ quan Đảng (theo Quyết định số 260-QĐ/TW của Ban Bí thư), giai đoạn 2017 - 2020.